Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dtx4Q6PDK8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx4Q6PDK8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms