Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC8

Mfsd4a, Major facilitator superfamily domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4aQ6PDC8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mfsd4aQ6PDC8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Mfsd4aQ6PDC8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms