Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rrp12Q6P5B0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rrp12Q6P5B0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms