Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg2aQ6P4T0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg2aQ6P4T0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms