Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrimpolQ6P1E7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrimpolQ6P1E7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms