Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Slx4Q6P1D7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Slx4Q6P1D7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms