Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pdcd11Q6NS46 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pdcd11Q6NS46 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms