Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc66Q6NS45 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc66Q6NS45 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms