Protein–RNA interactions for Protein: Q6IR41

C1qtnf6, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf6Q6IR41 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C1qtnf6Q6IR41 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C1qtnf6Q6IR41 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms