Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmcc1Q69ZZ6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms