Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CltcQ68FD5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CltcQ68FD5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CltcQ68FD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms