Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrrc8eQ66JT1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms