Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pou4f3Q63955 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pou4f3Q63955 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms