Protein–RNA interactions for Protein: Q62513

Znf260, Zinc finger protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf260Q62513 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf260Q62513 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf260Q62513 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms