Protein–RNA interactions for Protein: Q62245

Sos1, Son of sevenless homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sos1Q62245 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sos1Q62245 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sos1Q62245 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sos1Q62245 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sos1Q62245 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sos1Q62245 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sos1Q62245 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sos1Q62245 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms