Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ssr4Q62186 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssr4Q62186 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms