Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sin3bQ62141 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sin3bQ62141 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms