Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PrkciQ62074 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PrkciQ62074 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms