Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prg2Q61878 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prg2Q61878 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms