Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Msi1Q61474 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Msi1Q61474 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms