Protein–RNA interactions for Protein: Q61271

Acvr1b, Activin receptor type-1B, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1bQ61271 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Acvr1bQ61271 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Acvr1bQ61271 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms