Protein–RNA interactions for Protein: Q61189

Clns1a, Methylosome subunit pICln, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clns1aQ61189 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clns1aQ61189 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clns1aQ61189 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms