Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
JrkQ60976 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
JrkQ60976 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms