Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Stxbp3Q60770 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Stxbp3Q60770 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms