Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Samhd1Q60710 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Samhd1Q60710 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms