Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sik1Q60670 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sik1Q60670 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms