Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atp13a3Q5XF89 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atp13a3Q5XF89 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms