Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ncoa4Q5U4H9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ncoa4Q5U4H9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms