Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scaf1Q5U4C3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scaf1Q5U4C3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms