Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ggnbp2Q5SV77 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ggnbp2Q5SV77 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms