Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psme4Q5SSW2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psme4Q5SSW2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms