Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TefmQ5SSK3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms