Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms