Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Smg7Q5RJH6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms