Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rapgef6Q5NCJ1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rapgef6Q5NCJ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms