Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DroshaQ5HZJ0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DroshaQ5HZJ0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DroshaQ5HZJ0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms