Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nlrc3Q5DU56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nlrc3Q5DU56 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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