Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lrrc8bQ5DU41 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 520.2 ms