Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CenpjQ569L8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CenpjQ569L8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms