Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Spire1Q52KF3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spire1Q52KF3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms