Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccnl1Q52KE7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccnl1Q52KE7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms