Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc47Q505F5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrc47Q505F5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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