Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc84Q4VA36 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc84Q4VA36 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms