Protein–RNA interactions for Protein: Q3V460

Smim26, Gene model 561, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim26Q3V460 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Smim26Q3V460 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms