Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Usp48Q3V0C5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp48Q3V0C5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp48Q3V0C5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp48Q3V0C5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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Usp48Q3V0C5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp48Q3V0C5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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