Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZY0

Sfi1, Protein SFI1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfi1Q3UZY0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sfi1Q3UZY0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfi1Q3UZY0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms