Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnpc3Q3UZ01 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms