Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chpf2Q3UU43 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chpf2Q3UU43 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms