Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW4

B230104I21Rik, RIKEN cDNA B230104I21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230104I21RikQ3USW4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
B230104I21RikQ3USW4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
B230104I21RikQ3USW4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms