Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6899Q3USS0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms